07.SingleChannel(limma)
07.SingleChannel()所属R语言包:limma
Individual Channel Analysis of Two-Color Microarrays
两色的微阵列的单个通道分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This page gives an overview of the LIMMA functions fit linear models to two-color microarray data in terms of the log-intensities rather than log-ratios.
此页面提供了概述的LIMMA功能log强度两色的微阵列数据,而不是登录比率符合线性模型。
The function intraspotCorrelation estimates the intra-spot correlation between the two channels. The regression function lmscFit takes the correlation as an argument and fits linear models to the two-color data in terms of the individual log-intensities. The output of lmscFit is an MArrayLM object just the same as from lmFit, so inference proceeds in the same way as for log-ratios once the linear model is fitted. See 06.LinearModels.
功能intraspotCorrelation估计当场内两个通道之间的相关性。回归函数lmscFit作为参数的相关性和适合个人log强度两色数据的线性模型。 lmscFit输出是MArrayLM对象只是lmFit,所以在log比同样的方式推断,一旦装有线性模型所得的相同。看到06.LinearModels。
The function targetsA2C converts two-color format target data frames to single channel format, i.e, converts from array-per-line to channel-per-line, to facilitate the formulation of the design matrix.
函数targetsA2C两色格式的目标数据框转换成单声道格式,即从数组每行每行通道的转换,以便制订的设计矩阵。
作者(S)----------Author(s)----------
Gordon Smyth
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