avearrays(limma)
avearrays()所属R语言包：limma
Average Over Replicate Arrays
复制阵列的平均
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Condense a microarray data object so that technical replicate arrays are replaced with (weighted) averages.
凝聚一个芯片的数据对象，所以，技术的重复阵列（加权）平均取代。
用法----------Usage----------
## Default S3 method:[默认方法]
avearrays(x, ID=colnames(x), weights=NULL)
## S3 method for class 'MAList'
avearrays(x, ID=colnames(x), weights=x$weights)
## S3 method for class 'EList'
avearrays(x, ID=colnames(x), weights=x$weights)
参数----------Arguments----------
参数：x
a matrix-like object, usually a matrix, MAList or EList object.
一个矩阵类的对象，通常是一个矩阵，MAList或EList对象。
参数：ID
sample identifier.
样品标识。
参数：weights
numeric matrix of non-negative weights
数字矩阵的非负权重
Details
详情----------Details----------
A new data object is computed in which technical replicate arrays are replaced by their (weighted) averages.
一个新的数据对象计算技术复制阵列（加权）平均取代。
For an MAList object, the components M and A are both averaged in this way, as are weights and any matrices found in object$other.
MAList对象，组件M和A都平均在这种方式，是weights和任何矩阵object$other发现。
EList objects are similar, except that the E component is averaged instead of M and A.
EList对象是类似除E组件的平均值，而不是M和A，。
If x is of mode "character", then the replicate values are assumed to be equal and the first is taken as the average.
x如果模式"character"，然后复制值被认为是平等的，首先是采取平均。
值----------Value----------
A data object of the same class as x with a row for each unique value of ID.
同一类的数据对象x一排每个ID的独特价值。
作者（S）----------Author(s)----------
Gordon Smyth
参见----------See Also----------
avereps.
avereps。
02.Classes gives an overview of data classes used in LIMMA.
02.Classes给在LIMMA使用的数据类的概述。
举例----------Examples----------
x <- matrix(rnorm(8*3),8,3)
colnames(x) <- c("a","a","b")
avearrays(x)
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注：
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发表于 2012-2-25 23:11:11
