R语言 trio包 getMatPseudo()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getMatPseudo(trio)
getMatPseudo()所属R语言包：trio

                                         Generates Case-Pseudo-Control Matrix
                                         生成案例伪控制矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates a matrix containing the genotypes of the cases and the corresponding three pseudo-controls (i.e. the genotypes of the children and the respective corresponding three genotypes not transmitted from the parents).
生成矩阵的基因型的情况下，相应的三个伪控制（即基因型的儿童和各自相应的三种基因型的父母不发送）。


用法----------Usage----------


getMatPseudo(mat.snp)



参数----------Arguments----------

参数：mat.snp
a numeric matrix in which each column represents a SNP. Each column must be a numeric vector of length 3 * t representing a SNP genotyped at t trios. Each of the t blocks must consist of the genotypes of father, mother, and offspring (in this order). The genotypes must be coded by 0, 1, and 2. Missing values are allowed and need to be coded by NA. This matrix might be generated from a ped-file by, e.g., employing ped2geno.  
一个数字矩阵，其中每一列代表一个SNP。每列必须是一个数值向量的长度3 * t较SNP基因分型t三重奏。 t块必须由基因型的父亲，母亲和后代（按照这个顺序）。必须被编码的基因型，0，1，和2。遗漏值是允许的，需要进行编码NA。这个矩阵可能会产生的一个PED文件，例如，采用ped2geno。


值----------Value----------

A matrix with 4 * t rows, in which each block of four consecutive rows consists of the genotypes of the SNPs in mat.snp for the case and the three matched pseudo-controls corresponding to the respective block in mat.snp.
4 * t行，四个连续的行，其中每个块包括在mat.snp对应于各块中的情况下，三个匹配的伪控制<X的SNP的基因型与A矩阵>。


（作者）----------Author(s)----------



Holger Schwender, <a href="mailto:holger.schwender@udo.edu">holger.schwender@udo.edu</a>




参见----------See Also----------

colTDT, colTDT2way, colGxE
colTDT，colTDT2way，colGxE

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注：
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