R语言 limma包 avedups()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

avedups(limma)
avedups()所属R语言包：limma

                                        Average Over Duplicate Spots
                                         平均重复景点

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Condense a microarray data object so that values for within-array replicate spots are replaced with their average.
凝聚一个芯片的数据对象，阵内复制点的值，使他们的平均取代。


用法----------Usage----------


## Default S3 method:[默认方法]
avedups(x, ndups=2, spacing=1, weights=NULL)
## S3 method for class 'MAList'
avedups(x, ndups=x$printer$ndups, spacing=x$printer$spacing, weights=x$weights)
## S3 method for class 'EList'
avedups(x, ndups=x$printer$ndups, spacing=x$printer$spacing, weights=x$weights)



参数----------Arguments----------

参数：x
a matrix-like object, usually a matrix, MAList or EList object.
一个矩阵类的对象，通常是一个矩阵，MAList或EList对象。


参数：ndups
number of within-array replicates for each probe.
阵内每个探针复制。


参数：spacing
number of spots to step from a probe to its duplicate.
数点，以加强从探针的重复。


参数：weights
numeric matrix of spot weights.
现货重量的数字矩阵。


Details

详情----------Details----------

A new data object is computed in which each probe is represented by the (weighted) average of its duplicate spots. For an MAList object, the components M and A are both averaged in this way. For an EList object, the component E is averaged in this way.
一个新的数据对象，其中每个探针重复点（加权）平均计算。 MAList对象，组件M和A都在这样的平均。 EList对象，组件E平均在这种方式。

If x is of mode "character", then the duplicate values are assumed to be equal and the first is taken as the average.
x如果模式"character"，然后重复值被认为是平等的，首先是采取平均。


值----------Value----------

A data object of the same class as x with 1/ndups as many rows.
同一类的数据对象x1/ndups许多行。“


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

avereps.
avereps。

02.Classes gives an overview of data classes used in LIMMA.
02.Classes给在LIMMA使用的数据类的概述。

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